Η ψηφοφορία θα είναι ηλεκτρονική και η διαδικασία θα ξεκινήσει στις 9.00 το πρωί και θα ολοκληρωθεί στις 6.00 το απόγευμα, ενώ τα αποτελέσματα θα είναι γνωστά την ίδια μέρα. Δικαίωμα ψήφου έχουν 589 εκλέκτορες (καθηγητές και λέκτορες του ιδρύματος) από τις σχολές και τα τμήματα στις τέσσερις πόλεις του ιδρύματος (Κομοτηνή, Ξάνθη, Αλεξανδρούπολη, Ορεστιάδα).
Σε περίπτωση που κάποιος από τους υποψηφίους δεν συγκεντρώσει την απόλυτη πλειοψηφία, η εκλογική διαδικασία θα επαναληφθεί την επόμενη μέρ α, Τρίτη 24 Ιουνίου.
