Υπερασπιζόμενος τη συμφωνία, είπε ότι «είναι καλή και για τα δύο κράτη, και ειδικά για την Ελλάδα, γιατί ανοίγει νέους δρόμους επικοινωνίας και συνεργασίας με τον βόρειο γείτονά μας, την νυν αποκαλούμενη Βόρεια Μακεδονία».
Αντίθετα ήταν επικριτικός με τις «εύκολες κατηγορίες» που εκτοξεύονται στο ελληνικό Κοινοβούλιο «για προδοσία και για πατριωτισμό» και εξέφρασε τις ανησυχίες του για «τα πρώτα φαινόμενα ενός βαθύτερου διχασμού».
Για τη στάση που θα κρατήσει τελικά Το Ποτάμι σε σχέση με την Συμφωνία των Πρεσπών, ο . Γραμματικάκης είπε ότι το κόμμα του πήρε καθαρή θέση υπέρ της συμφωνίας στο συνέδριο και τάχθηκε «κατά μίας επιπλέον γραμμής» σε ένα περιβάλλον γενικής σύγχυσης.
Ως προς το ενδεχόμενο συνεργασίας με τη Νέα Δημοκρατία, ο ευρωβουλευτής του Ποταμιού θύμισε ότι «το θέμα απορρίφθηκε στο συνέδριο, όπου αποφασίστηκε το Ποτάμι να κρατήσει την αυτονομία του στην πολιτική ζωή και σημείωσε ότι «ένα κόμμα πρέπει να είναι σταθερό στις αρχές του, παρά τις δυσκολίες που φαίνονται στις δημοσκοπήσεις».
Εξέφρασε δε προβληματισμό για τα στελέχη του ΚΙΝΑΛ που είτε δεν τοποθετούνται ή τοποθετούνται αρνητικά έναντι της Συμφωνίας των Πρεσπών, εκφράζοντας τη γνώμη ότι «κρύβει περισσότερο κομματικό συμφέρον, παρά πραγματική πεποίθηση».
