Με την υποβολή της τροποποιητικής δήλωσης του Ε9 θα εκδοθεί νέο εκκαθαριστικό του ΕΝΦΙΑ, αν και στην περίπτωση που ο φόρος με το νέο εκκαθαριστικό μειώνεται πάνω από 300 ευρώ ο φορολογούμενος καλείται στην εφορία για να προσκομίσει τα δικαιολογητικά που τεκμηριώνουν τη μείωση
Εάν από την τροποποιητική δήλωση δεν προκύπτει ποσό φόρου για καταβολή, ή το αποτέλεσμα της εκκαθάρισης είναι χρεωστικό ή αφορά την υποβολή της 1ης τροποποιητικής δήλωσης και υπάρχει μείωση φόρου έως και 300 ευρώ, η εκκαθάριση πραγματοποιείται άμεσα από τη Διεύθυνση Ηλεκτρονικής Διακυβέρνησης (ΔΗΛΕΔ) και μπορεί να εκτυπωθεί από τον υπόχρεο η νέα πράξη προσδιορισμού φόρου ΕΝΦΙΑ.
