Τα πεδία κοινής δράσης των δύο φορέων περιλαμβάνουν τη δημιουργία Ανοικτού Πανεπιστημίου σε θεματικές ενότητες κοινού ενδιαφέροντος, εκδοτική συνεργασία, πρακτική άσκηση φοιτητών, έρευνα στα σχολεία για το επίπεδο γνώσης της ελληνικής ιστορίας και ειδικότερα της ιστορίας της Μακεδονίας, συντονισμένες ενέργειες δικτύωσης και προβολής δράσεων των δύο φορέων με δίκτυα και φορείς του εξωτερικού, αξιοποίηση και συνεργασία χρηματοδοτούμενων επιχειρησιακών (ευρωπαϊκών και ελληνικών) προγραμμάτων, κ.α.
Κατά την υπογραφή της συμφωνίας συνεργασίας μεταξύ του Πρύτανη του Πανεπιστημίου Μακεδονίας, καθηγητή Αχιλλέα Ζαπράνη, ο οποίος επισκέφτηκε την ΕΜΣ και του προέδρου της ΕΜΣ, ομότιμου καθηγητή του ΑΠΘ, Αθανάσιου Καραθανάση, επισημάνθηκε το κοινό ενδιαφέρον για την ανάπτυξη ερευνητικών δραστηριοτήτων και η ανάγκη δημιουργίας ενός συνεχούς διαύλου επικοινωνίας και ανταλλαγής τεχνογνωσίας με στόχο την ενίσχυση των σχέσεων και της πνευματικής όσο και παραγωγικής τους συνεργασίας.
