Εφόσον ο μετασχηματισμός αφορά τη συγχώνευση ή διάσπαση εταιρειών και πραγματοποιείται μόνο με τις γενικές διατάξεις του Ν. 4601/2019, ή και με την παράλληλη χρήση των φορολογικών κίνητρων που δίνονται με τις διατάξεις των Ν. 1297/1972 ή Ν. 4172/1993, το αποτέλεσμα του μεσοδιαστήματος φορολογείται στο όνομα των απορροφούμενων ή διασπώμενων εταιρειών, κατά περίπτωση.
Σε ότι αφορά στην υποβολή της δήλωσης φορολογίας εισοδήματος των απορροφούμενων εταιρειών, καθώς και των διασπώμενων εταιρειών, στην περίπτωση της κοινής διάσπασης, ως ημερομηνία λήξης του φορολογικού έτους τους είναι ο χρόνος ολοκλήρωσης του μετασχηματισμού, δηλαδή ο χρόνος καταχώρισης στο ΓΕΜΗ της εγκριτικής απόφασης του προϊσταμένου του ΓΕΜΗ. Κατά συνέπεια, η δήλωση υποβάλλεται μέχρι και την τελευταία εργάσιμη ημέρα του έκτου μήνα από την ημερομηνία ολοκλήρωσης του μετασχηματισμού στην αρμόδια ∆ΟΥ και όχι ηλεκτρονικά.
Όσον αφορά στη δήλωση φορολογίας εισοδήματος της νεοσυσταθείσας απορροφούσας εταιρείας ή των νεοσυσταθεισών επωφελούμενων από διάσπαση εταιρειών, κατά περίπτωση, εφόσον πρόκειται για συγχώνευση ή διάσπαση με σύσταση νέων εταιρειών, το πρώτο φορολογικό έτος έχει έναρξη την ημερομηνία ολοκλήρωσης του μετασχηματισμού, και η νεοσυσταθείσα εταιρεία φορολογείται για τις πράξεις που πραγματοποιούνται από την ημερομηνία αυτή και μετά.
Σε περίπτωση συγχώνευσης ή διάσπασης με απορρόφηση από υφιστάμενη εταιρεία, η απορροφούσα ή επωφελούμενη εταιρεία υποβάλλει τη δήλωση φορολογίας εισοδήματός της με βάση το φορολογικό της έτος. Σε ότι αφορά στη μετατροπή εταιρείας, η προερχόμενη από τη μετατροπή εταιρεία υποβάλλει δήλωση φορολογίας εισοδήματος για όλο το φορολογικό έτος εντός του οποίου ολοκληρώνεται η μετατροπή, στην οποία περιλαμβάνεται τόσο το αποτέλεσμα των πράξεων που διενεργήθηκαν από τη μετατραπείσα όσο και από την προερχόμενη από τη μετατροπή εταιρεία και φορολογείται για το συνολικό αποτέλεσμα όλου του φορολογικού έτους.
Τα ανωτέρω διαφοροποιούνται για τους μετασχηματισμούς που εφαρμόζουν τις διατάξεις του Ν. 2166/1993 λόγω των ιδιαιτεροτήτων αυτού του νόμου. Στις περιπτώσεις αυτές προβλέπεται ότι κατά την έναρξη της διαδικασίας μετασχηματισμού οι συγχωνευόμενες (απορροφούμενες) εταιρείες συντάσσουν ισολογισμό μετασχηματισμού και φορολογούνται για τα τυχόν κέρδη που προκύπτουν μέχρι του χρόνου σύνταξης αυτού του ισολογισμού.
